
當前位置(zhi):首(shou)頁 > 產(chan)品(pin)中心(xin) > siTOOLs Biotech > riboPOOL > dp-K024/96-000031rRNA去除探針-植物通(tong)用(yong)型(被(bei)子植物)

簡(jian)要描述:riboPOOL核(he)糖(tang)體(ti)rRNA去除探針-植物通(tong)用(yong)型(被(bei)子植物)riboPOOLs核(he)糖(tang)體(ti)RNAs(rRNA)約占RNA-Seq數據讀取(qu)量的(de)90%,去除後可(ke)大(da)大(da)節(jie)省(sheng)RNA-seq的(de)測(ce)序成(cheng)本。riboPOOL可以高(gao)效和(he)特(te)異(yi)性地去除rRNAs,適(shi)合(he)大(da)多種模式和(he)非(fei)模式物種或RNA序列。
產(chan)品(pin)分(fen)類(lei)
Product Category相(xiang)關文(wen)章(zhang)
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| 品(pin)牌(pai) | 其他(ta)品(pin)牌(pai) | 供貨(huo)周期 | 壹個月 |
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riboPOOL核(he)糖(tang)體(ti)rRNA去除探針-植物通(tong)用(yong)型(被(bei)子植物)riboPOOLs(被(bei)子植物353探針)
riboPOOL 靈活(huo)高(gao)效的去除核(he)糖(tang)體(ti)RNA
核(he)糖(tang)體(ti)RNAs(rRNA)約占RNA-Seq數據讀取(qu)量的(de)90%,去除後可(ke)大(da)大(da)節(jie)省(sheng)RNA-seq的(de)測(ce)序成(cheng)本。riboPOOL可以高(gao)效和(he)特(te)異(yi)性地去除rRNAs,適(shi)合(he)大(da)多種模式和(he)非(fei)模式物種或RNA序列。
riboPOOL 的主(zhu)要優(you)勢(shi)
(1)種類(lei)豐(feng)富:豐富的成(cheng)品(pin)型(xing)目(mu)錄(lu)可(ke)供(gong)選擇(ze),目(mu)錄(lu)持(chi)續(xu)更(geng)新中;目(mu)錄(lu)以(yi)外(wai)物種或RNA可(ke)以(yi)定(ding)制
(2)工(gong)作(zuo)流(liu)程(cheng)快(kuai):壹(yi)步(bu)法,完整(zheng)工(gong)作(zuo)流(liu)程(cheng)僅用(yong)時70min
(3)起(qi)始量範(fan)圍(wei)廣(guang)泛(fan):在(zai)100 ng到(dao)5μg的(de)RNA起(qi)始量之(zhi)間(jian)都有(you)很(hen)好(hao)的去除效率
(4)針對特(te)殊應(ying)用(yong)定向(xiang)優(you)化:ibosome profiling樣(yang)本;環境轉(zhuan)錄(lu)組(zu)學(xue)(如土(tu)壤(rang)、汙泥(ni))
(5)高(gao)效的去除:去除效率高(gao),結(jie)果(guo)穩(wen)定可(ke)重(zhong)復(fu)
(6)搭(da)配靈(ling)活(huo):兼容各(ge)種RNA純化和(he)RNA建(jian)庫(ku)方(fang)法
(7)探針法:沒(mei)有(you)酶(mei)切(qie)偏(pian)好(hao),可(ke)以均(jun)壹(yi)的(de)覆(fu)蓋轉(zhuan)錄(lu)本;無打(da)斷(duan)樣(yang)本風險;適(shi)用(yong)於無polyA結構(gou)的(de)RNA(如(ru)snoRNA,LncRNA, 組(zu)蛋白)
(8)兼容多(duo)種下遊(you)分(fen)析方(fang)法:如RNA-Seq、微(wei)陣(zhen)列分(fen)析和(he)實(shi)時(shi)定量PCR等(deng)
可(ke)混(hun)合(he)使(shi)用(yong):客戶(hu)可(ke)根據樣(yang)本的組成(cheng)比(bi)例(li),混(hun)合使用(yong)2-4種riboPOOL,如病原體(ti)感染(ran)的人體(ti)組織(人(ren)源+原核(he)通用(yong)型)、人(ren)血(xue)液(ye)樣(yang)本(人源+人血(xue)珠(zhu)蛋白(bai))、植物微(wei)生物群(qun)研究(jiu)(植物通(tong)用(yong)型+原(yuan)核(he)通用(yong)型)
目(mu)錄(lu) 成(cheng)品(pin)型(xing) riboPOOL
riboPOOL 工(gong)作(zuo)流(liu)程(cheng)
riboPOOL 有(you)效起始量範(fan)圍(wei)(100ng-5ug)
riboPOOL 可混合(he)使(shi)用(yong)(復(fu)合(he)型(xing))
測(ce)試(shi)樣(yang)本為(a)SW48 細(xi)胞 (人源), NIH3T3細(xi)胞 (小(xiao)鼠(shu))和(he)DH10B株(zhu)大(da)腸桿(gan)菌RNA混(hun)合物。 實(shi)驗(yan)比(bi)較(b)單(dan)獨使用(yong)人源、鼠源、原核(he)通用(yong)型riboPOOL和(he)(c)使(shi)用(yong)復(fu)合(he)型(xing)riboPOOL(由(you)1:1:1的(de)人(ren)源、鼠 源、原核(he)通用(yong)型riboPOOL混(hun)合構(gou)成(cheng)),兩者均(jun)可(ke)有(you)效去除1μg RNA混合(he)樣(yang)本中的(de)rRNA. rRNA的(de)去除效率用(yong)生物分(fen)析儀,或rtqPCR分(fen)析評估(用(yong)rRNA或GAPDH(管(guan)家基因(yin))特(te)異(yi)性的引物進(jin)行實時定 量PCR )。
人源/小(xiao)鼠(shu)/大(da)鼠riboPOOLs
可(ke)去除細(xi)胞質rRNA (28S, 18S, 5.8S & 5S rRNA)&線粒體(ti)rRNA
高(gao)質(zhi)量(liang)RNA(RIN >7),rRNA去除效率可達(da)97%-98%
降解RNA/FFPE(RIN<7),rRNA去除效率可達(da)87%-98%
Ribo-Seq(30nt片段(duan)),優(you)化不易去除區(qu)域探針密度,rRNA去除效率約75%
*不同(tong)實驗(yan)方(fang)案間有(you)壹定(ding)差異(yi)
riboPOOL的rRNA去除效率高(gao)約10%
兩種試劑(ji)的(de)可(ke)重(zhong)復(fu)性相(xiang)當
原核(he)通用(yong)型(細(xi)菌/古(gu)生菌(jun))
覆(fu)蓋廣(guang)泛(fan)的原核(he)生物(細(xi)菌/古(gu)生菌(jun)),適(shi)合(he)微(wei)生物培(pei)養(yang)物、宏基因(yin)組(zu)、微(wei)生物組(zu)群分(fen)析
去除目(mu)標涵(han)蓋 5S, 16S and 23S rRNA
原(yuan)核(he)通用(yong)型 riboPOOL設(she)計(ji)依(yi)據
基於76個代表性物種的rRNAs 序列設(she) 計(ji)的微(wei)生物通(tong)用(yong)型 riboPOOL,適(shi)合(he)圖(tu) 中所(suo)示(shi)的類(lei)群(qun)(內(nei)圈(quan),粗(cu)體(ti))和(he)亞群(外圈(quan)) 所(suo)涵蓋的(de)細(xi)菌和(he)古(gu)細(xi)菌。

*如(ru)果(guo)您(nin)感(gan)興(xing)趣的物種不屬(shu)於(yu)這些類(lei)群(qun)或(huo)亞群,請咨詢我們的(de)定(ding)制型(xing)riboPOOLs產(chan)品(pin)。
**譯(yi)註:暫(zan)無中文(wen)譯(yi)名
原(yuan)核(he)通用(yong)型 riboPOOL已(yi)驗(yan)證(zheng)物種(RNA-Seq )
測試(shi)結(jie)果(guo)來(lai)自(zi)不同(tong)的實(shi)驗(yan)室(shi),rRNA去除效率從~50-98%不等(deng),在(zai)大(da)多數(shu)物種中rRNA去除效率>70% 。去除效率可能(neng)因(yin)樣(yang)品(pin)類(lei)型(xing)和(he)實(shi)驗(yan)條(tiao)件(jian)的不同(tong)而(er)不同(tong)。 高(gao)質(zhi)量(liang)的(de)RNA樣(yang)本中效率高(gao)。推(tui)薦的(de)起始RNA投放(fang)量(liang)為100 ng-5 μg。
植物通(tong)用(yong)型(被(bei)子植物)
可(ke)去除細(xi)胞質(28S, 18S, 5.8S & 5S) 、質(zhi)體(ti)和(he)線粒體(ti) rRNA
廣(guang)泛(fan)覆(fu)蓋開(kai)花(hua)植物
適(shi)合(he)葉(ye)片、種子和(he)根(gen)等(deng)各(ge)種組織部(bu)位
植物通(tong)用(yong)型 riboPOOL 可(ke)以覆(fu)蓋開(kai)花(hua)植物的(de)主(zhu)要門(men)類(lei)
包(bao)括30 多(duo)個目(mu)(見下圖(tu)) 常見物種,如下(xia):
水(shui)稻(dao) · 麻瘋(feng)樹(shu) · 大(da)豆·土(tu)豆 · 棉花(hua) · 咖啡(fei)·胡蘿(luo)蔔 · 洋(yang)薊 · 橄(gan)欖(lan)·擬(ni)南(nan)芥 · 玉(yu)米 · 翠(cui)菊·小(xiao)麥(mai) · 蘋(ping)果(guo) · 橙子·蕎(qiao)麥 · 及(ji)其(qi)他(ta)

*如果(guo)您(nin)感(gan)興(xing)趣的物種不屬(shu)於(yu)這些門(men)類(lei), 請(qing)咨詢我們的(de)定(ding)制型(xing) riboPOOL產(chan)品(pin)
植物通(tong)用(yong)型 riboPOOL的(de)β測試結(jie)果
開花(hua)植物的(de)去除效率大(da)於91% 值(zhi)得(de)註意(yi)的是,在(zai)原(yuan)始藻(zao)類(lei)綠(lv)藻(zao)中rRNA去除效率為80%,表(biao)明(ming)植物通(tong)用(yong)型riboPOOL可(ke)以應(ying)用(yong)於被(bei) 子植物以(yi)外的植物門(men)類(lei)。

riboPOOL核(he)糖(tang)體(ti)rRNA去除探針-植物通(tong)用(yong)型(被(bei)子植物)riboPOOLs 產(chan)品(pin)屬(shu)性
• 提(ti)供(gong)兩種產(chan)品(pin)形式,壹(yi)種是探針型,另(ling)壹(yi)種是完整(zheng)試(shi)劑(ji)盒(he),兩種形式均(jun)提(ti)供(gong)試(shi)驗(yan)方(fang)案。
• 產(chan)品(pin)以(yi)凍幹形式室(shi)溫(wen)運(yun)輸。
• 復(fu)溶(rong)後,在(zai)-20℃或(huo)以(yi)下(xia)的溫度,可(ke)穩(wen)定保存12個月。建(jian)議(yi)分(fen)裝儲(chu)存(cun),避免多(duo)次(ci)凍融。
訂購信息(xi)
請(qing)說明(ming)訂購的物種名稱(cheng)(見目(mu)錄(lu) 成(cheng)品(pin)型(xing)),產(chan)品(pin)種類(lei)(探針/試劑(ji)盒(he)/定(ding)制型(xing)),產(chan)品(pin)規(gui)格

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