16S+ITS測(ce)序(xu)是(shi)對(dui)特定(ding)長(chang)度(du)的PCR產(chan)物或者(zhe)捕獲的片(pian)段進(jin)行(xing)測(ce)序(xu)，目(mu)前(qian)主要(yao)是(shi)應用高通量(liang)測(ce)序(xu)技(ji)術(shu)對(dui)特定(ding)環境中(zhong)特定(ding)遺傳物質(zhi)進(jin)行(xing)測(ce)序(xu)。大(da)多(duo)數天然微生(sheng)物都(dou)不能(neng)通過傳統的分(fen)離培養方法(fa)進(jin)行(xing)分(fen)離和克隆(long)，這(zhe)對(dui)於天然微生(sheng)物定(ding)性和定量(liang)，探索(suo)微(wei)生(sheng)物多(duo)樣性(xing)是(shi)嚴(yan)重(zhong)的挑(tiao)戰。擴(kuo)增(zeng)子測(ce)序(xu)可(ke)以克服傳統分離培養的弱點，對(dui)樣品中(zhong)的微(wei)生物進(jin)行(xing)定(ding)性(xing)和定量(liang)，目前在微生物多(duo)樣性(xing)檢(jian)測(ce)中(zhong)廣(guang)泛(fan)應用(yong)。 16S+ITS測(ce)序(xu)的原(yuan)理和用途(tu)：
16SrDNA測(ce)序(xu)：16SrDNA是(shi)編碼16SrRNA的基(ji)因，存在於所(suo)有細(xi)菌(jun)基(ji)因組(zu)。其(qi)既能(neng)體(ti)現(xian)不(bu)同菌(jun)屬(shu)之(zhi)間的差異(yi)，又能(neng)利用(yong)測(ce)序(xu)技(ji)術(shu)較容(rong)易(yi)地得(de)到(dao)其(qi)序(xu)列(lie)，目(mu)前被廣(guang)泛(fan)用於(yu)病(bing)原菌(jun)的檢(jian)測(ce)和鑒定(ding)。它的可(ke)變區(qu)經(jing)常(chang)用於不(bu)同微(wei)生(sheng)物群(qun)落的屬(shu)或種系統進(jin)化(hua)分(fen)類。
ITS測(ce)序(xu)：在(zai)真核(he)生(sheng)物中(zhong)，18SrDNA和28SrDNA轉錄間(jian)隔序(xu)列(lie)稱(cheng)為(wei)ITS區。由(you)於(yu)其(qi)是(shi)非轉錄區(qu)，承(cheng)受的選(xuan)擇(ze)壓力(li)較(jiao)小(xiao)，變異強(qiang);屬(shu)於中(zhong)度(du)保(bao)守(shou)區域(yu)，利用(yong)它(ta)可(ke)研(yan)究種及(ji)種以(yi)下的分(fen)類階(jie)元。
16S+ITS測(ce)序(xu)技(ji)術(shu)優勢(shi)：
較(jiao)低的成(cheng)本：與(yu)宏基(ji)因組(zu)測(ce)序(xu)相(xiang)比(bi)，對(dui)測(ce)序(xu)深(shen)度(du)的要(yao)求更低，性價比(bi)較高(gao)；
鑒定(ding)效(xiao)率(lv)高：與克隆(long)或培養等傳統鑒定方法(fa)相比(bi)，微生物群(qun)16S/ITS測(ce)序(xu)是(shi)壹種更快、更準(zhun)確(que)的方(fang)法(fa)。
高靈(ling)敏(min)度(du)：可(ke)以鑒(jian)定(ding)出(chu)豐(feng)度(du)極(ji)低的細(xi)菌(jun)。
雙(shuang)區(qu)檢(jian)測(ce)：針(zhen)對(dui)壹個(ge)或多(duo)個(ge)可(ke)變區(qu)域(yu)的靈(ling)活性(xing)，能夠進(jin)行(xing)更長(chang)的序(xu)列(lie)讀取，並(bing)能(neng)夠(gou)對(dui)菌(jun)落進(jin)行(xing)更準(zhun)確(que)的分(fen)析。
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