DNA分(fen)子的功(gong)能是貯(zhu)存決(jue)定(ding)物(wu)種(zhong)性(xing)狀(zhuang)的(de)幾(ji)乎所(suo)有蛋白(bai)質(zhi)和(he)RNA分(fen)子的全(quan)部(bu)遺傳(chuan)信息,對(dui)DNA信息的(de)解(jie)讀,對(dui)於我(wo)們研究(jiu)生命(ming)的奧(ao)秘、疾病的機理等有著重(zhong)要的(de)意(yi)義(yi)。DNA類的(de)文(wen)庫主(zhu)要分(fen)為:DNA小片(pian)段(duan)文庫(ku)、DNA大(da)片(pian)段(duan)文庫(ku)、Exon文(wen)庫、PCR-Free文庫(ku)和(he)單細胞(bao)文庫(ku)等。DNA建(jian)庫(ku)方(fang)法是分(fen)子生物(wu)學(xue)的(de)實(shi)驗(yan)原(yuan)理(li),其(qi)本(ben)質(zhi)就(jiu)是在(zai)待(dai)測片(pian)段(duan)兩端加上接(jie)頭的(de)過(guo)程(cheng)。
DNA小(xiao)片(pian)段(duan)文庫(ku)是指(zhi)片(pian)段(duan)大(da)小在(zai)1kb以下(xia)的(de)普通DNA文庫(ku)(200bp、350bp、500bp等),DNA小片(pian)段(duan)文庫(ku)可(ke)用(yong)來(lai)進(jin)行(xing)人重(zhong)測序,動(dong)植物(wu)、微(wei)生物(wu)的(de)de novo和(he)重(zhong)測序,16s rRNA測序,宏(hong)基(ji)因組(zu)測序等項目類型(xing)的(de)文庫(ku)構建(jian)。
DNA大(da)片(pian)段(duan)文庫(ku),又(you)稱之為末(mo)端(duan)配(pei)對(dui)(mate-paired)文(wen)庫(ku),片(pian)段(duan)長度大(da)於1kb,主(zhu)要用(yong)於動(dong)植物(wu),微(wei)生物(wu)的(de)de novo測(ce)序。
PCR-Free文庫,顧名(ming)思義,就(jiu)是在(zai)文(wen)庫(ku)構建(jian)過(guo)程(cheng)中不(bu)需要進(jin)行PCR的文(wen)庫。主(zhu)要是針(zhen)對(dui)壹(yi)些特殊樣本,比(bi)如(ru)GC含(han)量(liang)高(gao)、PCR擴增(zeng)困難(nan)的樣本和(he)PCR產(chan)物(wu)。不(bu)足(zu)之處在(zai)於所(suo)需的(de)樣(yang)本起始量(liang)較(jiao)少(shao)。
Exon文(wen)庫:人類外(wai)顯(xian)子組(zu)總(zong)共(gong)約(yue)30 Mb,占(zhan)人類基(ji)因組(zu)約(yue)1%,外(wai)顯(xian)子具(ju)有高(gao)度的(de)保(bao)守(shou)型,且大(da)部(bu)分疾病的致(zhi)病位點位於外(wai)顯(xian)子區。外顯(xian)子測序是指(zhi)利(li)用(yong)序列捕獲技(ji)術將(jiang)外(wai)顯(xian)子區域DNA捕(bu)捉(zhuo)並(bing)富集(ji)後進(jin)行高(gao)通量(liang)測序的基(ji)因組(zu)分析方(fang)法。Exon文(wen)庫(ku)主要用(yong)於人全(quan)外(wai)顯(xian)子測序和目標區域測(ce)序。
單細胞(bao)DNA文庫(ku):隨著(zhe)二(er)代測序技(ji)術的(de)發(fa)展,把壹(yi)次(ci)實(shi)驗(yan)測(ce)許(xu)多(duo)條DNA序列的這(zhe)個難(nan)題(ti)解(jie)決(jue)之後,壹(yi)次(ci)把壹(yi)個(ge)人的(de)全(quan)基(ji)因組(zu)給測(ce)出(chu)來,最(zui)極(ji)限的(de)情況(kuang),就(jiu)是樣(yang)本(ben)量(liang)少(shao)到(dao)壹(yi)個(ge)細胞(bao),就可(ke)以測(ce)出(chu)整個(ge)基(ji)因組(zu)的序列信息。
目(mu)前DNA建(jian)庫(ku)方(fang)法按(an)照接(jie)頭(tou)連接(jie)方(fang)式不(bu)同(tong)可(ke)分(fen)為五類:
1、PCR擴(kuo)增(zeng)子建(jian)庫(ku);
2、Swift法(fa)建(jian)庫(ku);
3、轉(zhuan)座酶(mei)法(fa)建(jian)庫(ku);
4、TA克(ke)隆(long)連接(jie)接(jie)頭建(jian)庫(ku);
5、平(ping)末(mo)端(duan)連接(jie)接(jie)頭建(jian)庫(ku)。
