壹(yi)、體外(wai)蛋白(bai)表達試劑盒(he)實(shi)驗(yan)前準(zhun)備(bei)
試劑解(jie)凍(dong)與儲(chu)存(cun)
CFPE Master Mix:從(cong)-80℃取出後置(zhi)於(yu)冰(bing)上(shang)緩慢解(jie)凍(dong),避免(mian)反(fan)復凍(dong)融(rong)(解(jie)凍(dong)後(hou)3小時(shi)內(nei)完(wan)成實(shi)驗(yan))。
陽性對(dui)照模板(T7P-GFP或(huo)LET):儲存(cun)於(yu)-20℃以下,解(jie)凍(dong)後(hou)同(tong)樣(yang)需冰(bing)上(shang)操作。
關(guan)鍵(jian)提示:使(shi)用(yong)無(wu)核(he)酸酶(mei)(Nuclease-Free)的(de)耗(hao)材(cai)和試劑,防止(zhi)DNA/RNA降解(jie)。
模板(ban)準(zhun)備(bei)
質粒模(mo)板:需高純度(如(ru)PCR純(chun)化試劑盒(he)處(chu)理(li)),洗脫(tuo)液使(shi)用(yong)無(wu)核(he)酸酶(mei)水(shui),避免(mian)鹽離子幹(gan)擾(rao)反(fan)應(ying)。
線(xian)性模(mo)板(ban):通過無(wu)縫克隆技術制(zhi)備(bei)後純(chun)化,濃度調(tiao)整至(zhi)10-100 ng/μL,確保(bao)蛋白(bai)質產量。
故(gu)障排查(zha):若(ruo)模(mo)板(ban)含(han)核(he)酸酶(mei)或(huo)抑(yi)制(zhi)劑(如(ru)Cl⁻、SDS),會導(dao)致(zhi)表達失敗(bai),需重新純化模板。
二、反(fan)應(ying)體系配(pei)置(zhi)
反(fan)應(ying)體系設(she)計(ji)
總反(fan)應(ying)體積:建議(yi)10 μL(可按比例(li)放(fang)大(da))。
組(zu)分(fen)添(tian)加順(shun)序(xu):
9 μL CFPE Master Mix(EC或(huo)ECL);
1 μL陽性對(dui)照模板(或(huo)目標(biao)DNA模(mo)板(ban),終(zhong)濃度10 ng/μL);
陰(yin)性對(dui)照:9 μL Master Mix + 1 μL無(wu)核(he)酸酶(mei)水(shui)。
關鍵(jian)提示:DNA模(mo)板(ban)對(dui)濃度敏(min)感(gan),需充(chong)分(fen)混(hun)勻(yun),避免(mian)移液誤(wu)差(cha)。
孵(fu)育(yu)條件優化
溫度:29℃(水(shui)浴鍋(guo)或(huo)培(pei)養箱預(yu)熱至目(mu)標溫(wen)度)。
時(shi)間:16小(xiao)時(shi)(過夜孵育(yu)可提高產量)。
故(gu)障排查(zha):若(ruo)孵(fu)育(yu)後無(wu)表達,檢(jian)查(zha)溫度是(shi)否(fou)穩定(ding)(避免(mian)冷凝(ning)水(shui)進入(ru)反(fan)應(ying)管)。
三、蛋白(bai)表達與檢(jian)測
表達驗證
SDS-PAGE電(dian)泳:取(qu)1-2 μL反(fan)應(ying)液與5×Loading Buffer混(hun)合,95℃煮沸5分(fen)鐘,跑膠檢(jian)測目(mu)標(biao)蛋白(bai)條帶。
熒(ying)光檢(jian)測:若(ruo)表達GFP等熒(ying)光蛋白(bai),可直接用(yong)紫(zi)外(wai)燈觀察(cha)熒(ying)光信(xin)號。
故(gu)障排查(zha):若(ruo)無(wu)條帶,檢(jian)查(zha)模板是否正(zheng)確(que)、反(fan)應(ying)體系是(shi)否汙(wu)染(ran)(如核(he)酸酶(mei)殘留)。
包涵體(ti)處(chu)理(li)
問題:原核(he)表達中常(chang)見(jian)蛋白(bai)不(bu)正(zheng)確(que)折(zhe)疊形(xing)成包(bao)涵體(ti)。
解(jie)決方(fang)案(an):
降低(di)誘(you)導(dao)溫度(如(ru)16℃)和誘(you)導(dao)劑濃度(如(ru)0.1 mM IPTG);
引(yin)入(ru)分(fen)子伴(ban)侶(lv)共表達;
包涵體(ti)純化後復性(常(chang)用(yong)尿素或(huo)鹽酸胍(gua)變(bian)性,再(zai)通(tong)過稀(xi)釋(shi)/透析復性)。
關(guan)鍵(jian)提示:復(fu)性需遵循“低溫、低(di)濃度、小(xiao)梯度”原(yuan)則(ze),可添(tian)加PEG8000或(huo)精氨(an)酸提高成功率(lv)。
四(si)、蛋白(bai)純化
粗(cu)分(fen)離與層(ceng)析(xi)純化
細(xi)胞裂(lie)解(jie):超聲破碎(功率(lv)30%,超聲3輪,每輪2次,冰(bing)上(shang)操作)或(huo)高壓勻(yun)漿。
離心過濾(lv):12000 rpm離(li)心30分(fen)鐘,獲取(qu)上(shang)清(qing)液。
親和層析:
His標簽(qian)蛋白(bai):用Ni-NTA瓊脂糖(tang)珠或(huo)磁(ci)珠純化,洗滌緩沖液含(han)20 mM咪唑,洗脫(tuo)緩沖液含(han)250 mM咪唑。
GST標(biao)簽(qian)蛋白(bai):用GST瓊脂糖(tang)珠純化,洗滌緩沖液含(han)0.1% Triton,洗脫(tuo)緩沖液含(han)10 mM還原(yuan)型谷(gu)胱(guang)甘肽(tai)。
故(gu)障排查(zha):若(ruo)純(chun)化後雜(za)蛋白(bai)多,可聯用(yong)離(li)子交(jiao)換(huan)層析(xi)(如陰(yin)/陽離(li)子交(jiao)換(huan)柱)或(huo)分(fen)子篩(凝(ning)膠過濾(lv))。
濃縮(suo)與緩沖液置(zhi)換(huan)
超濾(lv)濃縮(suo):使(shi)用(yong)30K超濾(lv)管,4℃離心(xin)濃縮(suo)蛋白(bai)至目標體(ti)積(ji)。
脫(tuo)鹽柱置(zhi)換(huan):將蛋白(bai)緩沖液置(zhi)換(huan)為(wei)PBS或(huo)其(qi)他(ta)適(shi)宜(yi)緩沖液。
關鍵(jian)提示:超濾(lv)時(shi)避免(mian)蛋白(bai)沈澱(可添(tian)加甘油或(huo)DTT穩定(ding)蛋白(bai))。
五、純度驗(yan)證與儲(chu)存(cun)
純度檢(jian)測
SDS-PAGE:考(kao)馬(ma)斯(si)亮藍染(ran)色(se),目(mu)標(biao)蛋白(bai)純度應(ying)>90%。
Western Blot:用特(te)異性抗(kang)體(ti)檢(jian)測目(mu)標(biao)蛋白(bai),減少非(fei)特(te)異性背(bei)景。
HPLC:高效(xiao)液相(xiang)色(se)譜(pu)進(jin)壹(yi)步驗(yan)證純度。
故(gu)障排查(zha):若(ruo)純(chun)度不(bu)足(zu),檢(jian)查(zha)純化標簽(qian)是否(fou)暴露全(如(ru)His標(biao)簽(qian)被遮(zhe)擋(dang)需優化表達條件)。
蛋白(bai)儲存
短(duan)期(qi)儲(chu)存(cun):4℃保(bao)存(cun)(含(han)50%甘(gan)油),避免(mian)反(fan)復凍(dong)融(rong)。
長(chang)期(qi)儲存(cun):-80℃分(fen)裝保(bao)存(cun),添(tian)加蛋白(bai)酶抑(yi)制(zhi)劑(如(ru)PMSF)防止(zhi)降解(jie)。
關鍵(jian)提示:儲(chu)存(cun)前需測定(ding)蛋白(bai)濃度(如(ru)BCA法(fa)),並記(ji)錄純度數(shu)據(ju)。
六、體(ti)外(wai)蛋白(bai)表達試劑盒(he)常(chang)見(jian)問題與解(jie)決方(fang)案(an)總結
| 問題 | 可能原(yuan)因 | 解(jie)決方(fang)案(an) |
| 蛋白(bai)不(bu)表達 | 模板(ban)質量差(cha)、反(fan)應(ying)體系汙(wu)染(ran) | 重新純化模板,使(shi)用(yong)無(wu)核(he)酸酶(mei)耗材,檢(jian)查(zha)陽性對(dui)照是否表達 |
| 包涵體(ti)形成 | 表達過快(kuai)、缺(que)少翻譯後修(xiu)飾 | 降(jiang)低誘(you)導(dao)溫度/濃度,引(yin)入(ru)分(fen)子伴(ban)侶(lv),包涵體(ti)復性 |
| 純(chun)化後雜(za)蛋白(bai)多 | 純化方法單壹(yi)、標簽(qian)暴露不(bu)足(zu) | 聯(lian)用多種層(ceng)析方法(fa)(如(ru)親和+離子交(jiao)換(huan)),優化表達條件使(shi)標(biao)簽(qian)充(chong)分(fen)暴露 |
| 蛋白(bai)降解(jie) | 細(xi)菌(jun)蛋白(bai)酶作用(yong)、序(xu)列不(bu)穩定(ding) | 全程低(di)溫操作,添(tian)加蛋白(bai)酶抑(yi)制(zhi)劑,檢(jian)查(zha)蛋白(bai)序列N端原(yuan)則(ze),換(huan)用真(zhen)核(he)表達系統 |
| 儲(chu)存(cun)後蛋白(bai)活性下降 | 反(fan)復凍(dong)融(rong)、儲存(cun)條件不(bu)當(dang) | 分(fen)裝保(bao)存(cun),避免(mian)反(fan)復凍(dong)融(rong),優化儲存緩沖液(如添(tian)加甘油、DTT) |