被(bei)子(zi)植(zhi)物353探(tan)針(zhen)是(shi)壹種(zhong)采(cai)用靶(ba)向(xiang)捕(bu)獲(huo)探(tan)針(zhen)對特(te)定的基(ji)因組(zu)區域(yu)進行選擇(ze)性地富集,再進行測序的技(ji)術。被(bei)子(zi)植(zhi)物探(tan)針(zhen)的靶(ba)向(xiang)捕(bu)獲(huo)測(ce)序技(ji)術,從(cong)600種被(bei)子(zi)植(zhi)物中,篩(shai)選(xuan)353個(ge)單(dan)拷(kao)貝(bei)核基(ji)因,作(zuo)為捕獲(huo)序列(lie),利用生物素化的RNA探(tan)針(zhen)長度(du)120 bp,對被(bei)子(zi)植(zhi)物的353個(ge)單(dan)拷(kao)貝(bei)核基(ji)因進行定向(xiang)捕(bu)獲(huo)測(ce)序。該技(ji)術的優(you)勢在(zai)於(yu)去(qu)除(chu)冗(rong)余數據的幹(gan)擾(rao),同(tong)時(shi)降低(di)測(ce)序成本(ben)及(ji)基(ji)因組(zu)組裝的復(fu)雜(za)性,進而提高(gao)NGS數據的利用率,促進被(bei)子(zi)植(zhi)物的研(yan)究。
被(bei)子(zi)植(zhi)物353探(tan)針(zhen)是(shi)壹種(zhong)特(te)殊的寡(gua)核苷酸(suan)探(tan)針(zhen),可以(yi)與(yu)植(zhi)物基因組(zu)中大(da)約(yue)80%以上的基(ji)因進行高度(du)選(xuan)擇性的雜(za)交。這種探(tan)針(zhen)的設計基於被(bei)子(zi)植(zhi)物基因組(zu)中高(gao)度(du)保(bao)守(shou)的序列(lie)區域(yu),因此(ci)具有較高的特(te)異性和(he)敏感性,能(neng)夠(gou)在(zai)廣(guang)泛(fan)的植(zhi)物物種中使(shi)用。
被(bei)子(zi)植(zhi)物353探(tan)針(zhen)還可用(yong)於(yu)以下方(fang)面(mian):
揭示(shi)植(zhi)物基因表(biao)達譜:使(shi)用被(bei)子(zi)植(zhi)物探(tan)針(zhen)可以(yi)對植物基因組(zu)進行全面(mian)的表(biao)達分析(xi),揭示(shi)出(chu)植(zhi)物不同(tong)發(fa)育(yu)階段和(he)響應環(huan)境(jing)變化時(shi)的基(ji)因表(biao)達譜。通(tong)過(guo)對大量(liang)基因的表(biao)達水(shui)平進行定量(liang)測量(liang),科學(xue)家(jia)們(men)可以了(le)解(jie)植物生長和(he)發(fa)育(yu)過程(cheng)中哪些(xie)基(ji)因起著(zhe)重要作(zuo)用,從(cong)而為植(zhi)物育(yu)種和(he)生(sheng)產(chan)提供(gong)理論(lun)依(yi)據(ju)。
研(yan)究植物應對環境(jing)逆(ni)境(jing)的機(ji)制:植(zhi)物在(zai)面(mian)對各種環(huan)境(jing)逆(ni)境(jing)(如(ru)幹旱、鹽堿(jian)、低(di)溫等)時(shi),會(hui)觸(chu)發壹系(xi)列(lie)的基(ji)因調控網(wang)絡以(yi)適(shi)應環(huan)境(jing)的變化。利用被(bei)子(zi)植(zhi)物探(tan)針(zhen)可以(yi)分(fen)析(xi)植(zhi)物在(zai)逆(ni)境(jing)條(tiao)件下的基(ji)因表(biao)達變化,進而揭示(shi)出(chu)植(zhi)物應對逆境(jing)的分(fen)子(zi)機(ji)制和(he)信(xin)號(hao)傳(chuan)導(dao)途(tu)徑,為改良(liang)植(zhi)物品種(zhong)提供(gong)遺傳基(ji)礎(chu)。
探(tan)索(suo)植物進化歷(li)程(cheng):被(bei)子(zi)植(zhi)物探(tan)針(zhen)不僅可以(yi)在(zai)現代(dai)植物中使(shi)用,還可以(yi)用(yong)於研(yan)究植物進化歷(li)程(cheng)中的關(guan)鍵(jian)基因。通(tong)過(guo)與(yu)不(bu)同(tong)植(zhi)物物種進行比較分(fen)析(xi),科學(xue)家(jia)們(men)可以了(le)解(jie)這些(xie)物種在(zai)基(ji)因組(zu)水(shui)平上的差(cha)異和(he)變化,從(cong)而推測(ce)出(chu)植(zhi)物進化的演(yan)化過(guo)程(cheng)。